Космодесы 3 представляет собой повествование о группе бойцов, оказавшихся на трудной и опасной планете с враждебной фауной и неизвестными угрозами. Главный персонаж входит в состав отряда, который вынужден действовать в условиях отсутствия связи с внешним миром и ограниченного ресурса. Перед ними стоит задача выжить, а также разобраться с выявленной неподалеку угрозой — возможным гнездом опасных существ, которые угрожают безопасности людей. Обстановка осложняется тем, что первоначальная информация о количестве и расположении вражеских гнезд оказывается недостаточной или ошибочной, и бойцы сталкиваются с необходимостью адаптироваться к новым обстоятельствам.

Основной конфликт развивается вокруг поиска и уничтожения вражеских форм жизни, при этом бойцам приходится преодолевать физические трудности, оценивать обстановку с помощью сканеров и проводить разведку местности. Отряд испытывает давление не только со стороны внешних врагов, но и внутренних сомнений, связанных с потерями товарищей и опасениями по поводу собственной стратегии. По ходу событий становятся заметны детали ландшафта и поведения противника, которые вызывают вопросы и заставляют пересмотреть первоначальные предположения. Эта неопределённость приводит к тому, что группа вынуждена принять ряд рискованных решений для получения информации и обеспечения своей безопасности....