Физрук: на своей волне 2 затрагивает ситуацию, в которой меняется привычный порядок в школьной жизни из-за конфликта между учениками и педагогами. Обстановка осложняется поведением подростков, не привыкших к ответственности и работе, что приводит к напряжённости и недоверию. На фоне этих событий возникает необходимость вмешательства, чтобы восстановить порядок и наладить отношения между всеми участниками школьного процесса. Валерий Гуров вводит в повествование фигуру физрука — преподавателя, который оказывается в трудном положении, имея обязанности содержать дисциплину и одновременно справляться с вызовами нового времени и изменениями в подходах к воспитанию. Его задача состоит в том, чтобы объединить разрозненных школьников, направить их энергию в конструктивное русло и помочь им почувствовать себя полезными. События развиваются посредством попыток организовать совместную работу по благоустройству школьного двора, что становится не только проверкой для учеников, но и испытанием для наставника.

Проблемы возникают из-за незнания и нежелания подростков включаться в дела, а также сопротивления со стороны некоторых педагогов, что усложняет процесс воспитания. Усиливающиеся трудности ставят под сомнение исход затеи, ведь не все готовы принять перемены и взять на себя ответственность. В ответ на это физрук находит способы мотивировать ребят, используя как личный пример, так и вовлечение в общее дело. Конфликт постепенно даёт сдвиги, появляются признаки реакции и вовлечённости, хотя ситуация остаётся напряжённой и многогранной. Выстраиваются новые отношения власти и подчинения, лидерства и послушания, что отражает более широкие изменения в школьной среде. Итогом становится не окончательное разрешение, а движение к пониманию и поиску баланса между требованиями и возможностями, между старым и новым, что оставляет открытой тему дальнейших преобразований и выбора направлений развития.