Ученик. том -2, написанный Сергеем Вэллсом, описывает учебный процесс и непростые испытания, с которыми сталкиваются первогодки академии лекарского искусства. Ситуация осложняется тем, что группа студентов проходит практику вне стен учебного заведения, где к ним предъявляются высокие требования, а малейшие ошибки могут привести к исключению. В таких условиях ученики оказываются разделены по поселениям вблизи небольшого города, где каждый из них должен проявить себя самостоятельно, часто без постоянного контроля наставника. Среди этих студентов — Ян, который продолжает строгое обучение и сталкивается с необходимостью использовать свои только появившиеся знания и силы в лекарском деле. Его задача усложняется проблемами с лечением, а также конфликтами внутри группы. Уже на практике обнаруживается, что в коллективе возникают недопонимания и опасения, связанные с различными заболеваниями и неясностями в их диагностике.

На фоне болезней и тревог возникают подозрения по поводу целей и мотивов академии, а также опасения за своё будущее в учебном заведении. Взаимоотношения между учениками проявляются в форме напряжения и соперничества, что мешает слаженной работе. Ян, хоть и обладает определёнными умениями, вынужден решать, как справиться с новыми вызовами, связанными с лечением заболевших, освоением энергетического осмотра и преодолением напряжённой обстановки в группе. Его выборы и действия прямо влияют на ход событий и на возможность сохранения статуса ученика. В результате развивающегося конфликта выясняется, что многие трудности связаны не только с внешними испытаниями, но и с внутренними ограничениями и отношениями в коллективе. Ситуация остаётся напряжённой, а дальнейшие действия каждого из участников будут определять их дальнейшую судьбу в академии.