Ковчег Иуды создан Андреасом Грубером и разворачивается вокруг серии жестоких убийств, потрясших спокойствие небольшой австрийской общины. В центре событий — следователь Александр Кёрнер, работающий в земельной жандармерии Вены, который оказывается втянут в расследование, раскрывающее старые раны и скрытые тайны. Его положение осложняется личными переживаниями и давлением со стороны начальства, а обстоятельства требуют от него не только профессионализма, но и умения справляться с внутренними страхами и воспоминаниями. События начинают развиваться после обнаружения тела молодой девушки в заброшенной дискотеке в провинциальном поселке, что выводит на повестку старинное дело из 1930-х годов, связанное с аварией угольной шахты и загадочным уходом жителей. Расследование сталкивается с рядом препятствий, включая отсутствие ясных доказательств, усталость и ограниченность ресурсов, а также сопротивление окружения, не жаждущего возвращения прошлого. По мере изучения событий Кёрнер и его коллега Бергер погружаются в детали, пытаясь связать воедино свидетельства, планы местности и хронологию событий, однако полученные факты лишь множат вопросы.

Усложняется ситуация и внутриполитическими интригами, а также давлением на следствие, которое пытаются свернуть или отложить. Несмотря на сложности, Кёрнер не отказывается от поиска истины, пытаясь найти убийцу прежде, чем злодеи уничтожат его изнутри. В процессе расследования раскрываются реалии местной жизни, изменения в экономике региона и влияние исторических событий на настоящее. Конфликт развивается между желанием восстановить справедливость и препятствиями на пути к ней, включая внутренние демоны героя и внешние вызовы. Основным результатом становится необходимость принятия сложных решений и столкновение с вопросом, насколько возможно исправить прошлое, сохранив при этом собственную целостность и профессиональный долг.