Зараза 3: Королева — продолжение истории, в которой на фоне угрозы, связанной с древним злом и заражением, группа людей пытается защитить себя и найти выход из сложившейся ситуации. Обстановка характеризуется изоляцией, ограниченными ресурсами и постоянным риском для жизни. В центре внимания оказывается персонаж, который, несмотря на ограничения и неопределённость, старается разобраться в происходящем и помогает ориентироваться в новых условиях. Неопределённость усиливается вмешательством камаджоров — представителей местной группы, придерживающихся собственной версии опасности, и гостями лагеря, которым трудно принять реальность угрозы.

Ситуация меняется с появлением новых признаков заражения и проявлением зова, заставляющим персонажа и его спутников искать лекарства, оружие и способы эвакуации. Надежды связаны как с поиском ответа на «зов», так и с возможностью уничтожить источник зла, однако конкретные решения пока остаются неясными. Возникают разногласия по поводу мер безопасности и стратегии действий: одни готовы бороться с угрозой, другие склонны к бегству или выжиданию. Особое внимание уделено взаимодействию между местными и новыми членами группы, а также ограниченному запасу ресурсов и вооружения....